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      甲基化芯片研究設計策略

      • 分類:行業新聞
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      • 來源:
      • 發布時間:2022-07-20 11:25
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      【概要描述】一般來說,只要選擇了合適的技術方法、重復樣本的數量以及一定的檢測深度(范圍),所有設計都旨在探索生物標記/相互關系; 但對于甲基化芯片的生物學機制研究,建議主要采用縱向(時間過程)或梯度研究。 因為這樣設計,不僅可以捕捉穩定的甲基化變化趨勢,而且可以準確估計缺失樣本的數據,那么,下面一起了解下甲基化芯片研究設計策略吧!

      甲基化芯片研究設計策略

      【概要描述】一般來說,只要選擇了合適的技術方法、重復樣本的數量以及一定的檢測深度(范圍),所有設計都旨在探索生物標記/相互關系; 但對于甲基化芯片的生物學機制研究,建議主要采用縱向(時間過程)或梯度研究。 因為這樣設計,不僅可以捕捉穩定的甲基化變化趨勢,而且可以準確估計缺失樣本的數據,那么,下面一起了解下甲基化芯片研究設計策略吧!

      • 分類:行業新聞
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      • 發布時間:2022-07-20 11:25
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        一般來說,只要選擇了合適的技術方法、重復樣本的數量以及一定的檢測深度(范圍),所有設計都旨在探索生物標記/相互關系; 但對于甲基化芯片的生物學機制研究,建議主要采用縱向(時間過程)或梯度研究。 因為這樣設計,不僅可以捕捉穩定的甲基化變化趨勢,而且可以準確估計缺失樣本的數據,那么,下面一起了解下甲基化芯片研究設計策略吧!

        甲基化芯片實驗設計策略:

        1 .橫斷面設計:病例-對照研究

        甲基化芯片普遍采用的研究類型是將某一特定狀態(病例組)與典型狀態(對照組)進行比較,通常用于識別可能有助于刺激或對其他狀態的反應的因素。

        甲基化芯片優點-病例組/對照組樣本量相對龐大,增加了組間比較的統計效果;

        甲基化芯片缺點不同的分組標準可能會出現難以控制的復雜個體表型,導致出現甲基化疾病相關性的概率降低。

        2 .甲基化芯片縱向(時間過程)或漸進研究

        隨著多個時間點或參數的變化進行DNA甲基化檢測。 例如藥物梯度濃度,誘導后不同時間點,該設計可以觀察DNA甲基化的變化趨勢,過濾噪聲,提高結果的可靠性。 例如,隨著時間的推移和藥物濃度的變化,DNA甲基化明顯上升或下降的結果比在兩種條件下比較差異變化的結果更為可靠。

        3 .甲基化芯片雙胞胎(同卵)比較研究

        關于同卵雙胞胎性狀和疾病差異的研究,可能是較好的實驗方案,因為同卵雙胞胎可以排除遺傳變異和年齡問題,在一定程度上排除環境因素,樣本數:約25對同卵雙胞胎(需要考慮年齡和環境因素對受試者的影響)。

        4 .甲基化芯片多代家系遺傳研究

        雖然個體間年齡的影響不可避免,但由于個體間遺傳變異(DNA甲基化特征與年齡相關)的差異減小,出現新生變異和轉運效應,家系研究受到樣本數量少和臨床信息采集難度的限制。



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